224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1069 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  100 
 
 
264 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  44.84 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.75 
 
 
326 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  32.35 
 
 
278 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  36.29 
 
 
278 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.51 
 
 
270 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.22 
 
 
271 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  33.2 
 
 
413 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 
288 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.09 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  27.71 
 
 
259 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  33.68 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  31.8 
 
 
255 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  23.72 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.92 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.58 
 
 
168 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.78 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  32.52 
 
 
156 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  32.8 
 
 
161 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
163 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
178 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  37.5 
 
 
164 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
163 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  31.3 
 
 
156 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.2 
 
 
249 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  58.9  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  35.38 
 
 
156 aa  58.9  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  24.89 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  31.71 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  34.57 
 
 
161 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  32.54 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
156 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  29.47 
 
 
161 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 
156 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 
175 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  30.53 
 
 
156 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.06 
 
 
156 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  24.82 
 
 
181 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  32.52 
 
 
156 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.19 
 
 
173 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  26.19 
 
 
173 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  28.91 
 
 
156 aa  55.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  25.4 
 
 
171 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.64 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.91 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  56.1 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.65 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  29.6 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  28.23 
 
 
152 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  30 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  22.63 
 
 
181 aa  53.5  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  22.07 
 
 
168 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.36 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  53.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  27.73 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
156 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.36 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>