298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0516 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
163 aa  319  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  93.87 
 
 
163 aa  265  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  62.8 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  49.39 
 
 
164 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  36.48 
 
 
164 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  31.43 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  36.67 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  33.95 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.38 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  32.3 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  35.46 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  35.81 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  36 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  34 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  35.97 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  34 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  33.56 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  33.76 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  36.67 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  33.76 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.33 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.75 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
181 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  32.84 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  31.87 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  31.87 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32.85 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  35.17 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32.85 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  31.18 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0560  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0558474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  29.33 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  33.33 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  32.47 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0534  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_499  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000743335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.72 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.68 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  29.41 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.57 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  31.68 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  32.47 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  32.84 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.95 
 
 
326 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.05 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.95 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  31.01 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  29.09 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>