92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3055 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  56.47 
 
 		 270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  51.97 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  52.12 
 
 		 413 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.27 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  46.46 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.01 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  41.57 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.73 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  32.35 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  34.54 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  37.04 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  31.27 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  27.92 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.06 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.39 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  25.32 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.73 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  24.69 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.19 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  56.1 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  38.95 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.65 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  23.91 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  45.45 
 
 		 166 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  39.68 
 
 		 173 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  39.68 
 
 		 173 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  27.42 
 
 		 156 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  29.64 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  38.24 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  35 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  44.68 
 
 		 163 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  36.21 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  33.9 
 
 		 171 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  29.9 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  27.03 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 		 164 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  38.1 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  38.1 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  35.48 
 
 		 162 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  38.1 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 		 156 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  25.58 
 
 		 156 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 		 156 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 		 156 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  32.35 
 
 		 164 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 		 163 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.95 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  28.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  28.72 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  28.87 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.88 
 
 		 168 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  28.87 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  35.19 
 
 		 178 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  31.03 
 
 		 161 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 		 165 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 156 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  26.98 
 
 		 156 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>