98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0469 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 288 aa  577  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48.21 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48.03 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  45.56 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  43.53 
 
 		 413 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  41.73 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.16 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  40 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.73 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  37.96 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  33.33 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  33.84 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  32.95 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.26 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  24.7 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.23 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  24.68 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  39.13 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.48 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  46.55 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.83 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.53 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  23.85 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  47.46 
 
 		 163 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  45.76 
 
 		 163 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  21.79 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 		 161 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.55 
 
 		 173 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  26.55 
 
 		 173 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  44.23 
 
 		 164 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  21.29 
 
 		 162 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  28.72 
 
 		 161 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 		 164 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  29.6 
 
 		 156 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  33.73 
 
 		 189 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  31.39 
 
 		 164 aa  49.3  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  56.67 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.4 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  29.37 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  27.36 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  26.21 
 
 		 157 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0306  F0F1 ATP synthase subunit B  26.42 
 
 		 156 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000623248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 		 167 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 		 175 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  29.7 
 
 		 156 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  40.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  40.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  38.3 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  40.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  23.53 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  40.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  40.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  35.71 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  39.53 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  27.2 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.83 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  26.61 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.96 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  27.2 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  31.2 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  28.43 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  27.2 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3960  F0F1 ATP synthase subunit B  36.17 
 
 		 156 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  27.2 
 
 		 156 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  34.04 
 
 		 156 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  27.84 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  29.46 
 
 		 156 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  28.85 
 
 		 156 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  26.6 
 
 		 173 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>