107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2330 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  59.3 
 
 
326 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  51.3 
 
 
413 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  56.2 
 
 
278 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  44.69 
 
 
278 aa  234  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48.72 
 
 
291 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.74 
 
 
288 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.99 
 
 
270 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  43.43 
 
 
253 aa  192  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  39.47 
 
 
302 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  35.45 
 
 
264 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  38.37 
 
 
259 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  33.46 
 
 
255 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30.9 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.77 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  28.8 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.53 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  30.4 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.27 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  24.36 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.3 
 
 
156 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.67 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  31.3 
 
 
156 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  30.53 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  30.53 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.53 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.67 
 
 
234 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.95 
 
 
156 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  43.64 
 
 
166 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  29.77 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.85 
 
 
181 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  29.6 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  27.75 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
156 aa  52  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  29.6 
 
 
156 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  29.6 
 
 
156 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  29.77 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  29.77 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.07 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 
173 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 
173 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3960  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  41.3 
 
 
163 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  41.3 
 
 
163 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  44.74 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  30.08 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.12 
 
 
249 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  32.32 
 
 
156 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.65 
 
 
156 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.52 
 
 
203 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  32.79 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.7 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  40.48 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 
164 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.97 
 
 
164 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  29.51 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  30.33 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.63 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.33 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  22.37 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  31.18 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  28.69 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  32.41 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.51 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
171 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  37.5 
 
 
156 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0306  F0F1 ATP synthase subunit B  43.9 
 
 
156 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000623248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  27.84 
 
 
156 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.67 
 
 
175 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  24 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.54 
 
 
168 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
156 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
146 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
156 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  27.42 
 
 
156 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
156 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 
164 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
156 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  44.19 
 
 
156 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  28.16 
 
 
156 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  28.23 
 
 
156 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 
156 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  28.71 
 
 
156 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  25.6 
 
 
156 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>