79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1051 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.62 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  38.78 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.14 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.63 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  33.33 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  34.82 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  34.13 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.53 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  27.23 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1123  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.84 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  25.33 
 
 		 413 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  26.58 
 
 		 278 aa  88.6  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.27 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.25 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.34 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  27.73 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1296  ATP synthase F0, B subunit  34.01 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0153  ATP synthase F0, B subunit  34.01 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2646  putative ATP synthase F0, B subunit  34.01 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0129  ATP synthase F0, B subunit  34.01 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1049  ATP synthase F0, B subunit  34.01 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.68 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  31.15 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  27.71 
 
 		 253 aa  72  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0044  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.65 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  24.05 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.38 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.97 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  21.36 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  27.43 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  28.93 
 
 		 165 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  32.09 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.5 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.89 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.01 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.89 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.41 
 
 		 153 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.44 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  30.22 
 
 		 168 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  26.07 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.32 
 
 		 178 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.4 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.16 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  29.6 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  32.74 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  30.87 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  22.07 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.75 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  24.19 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.57 
 
 		 153 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.91 
 
 		 146 aa  45.4  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.79 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.57 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  25.48 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  24.09 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  22.22 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  25.15 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.36 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.96 
 
 		 164 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.85 
 
 		 154 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.63 
 
 		 158 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  27.98 
 
 		 156 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  26.43 
 
 		 167 aa  42.4  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>