50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0846 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  100 
 
 		 248 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  38.46 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  32.51 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.8 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.6 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.27 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.15 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  22.83 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  24.69 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.48 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  26.59 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  24.72 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  21.34 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.27 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.93 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  26.84 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  28.09 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.3 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  32.16 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  24.89 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.29 
 
 		 141 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  25.31 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  28.97 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  32.35 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  35.82 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.93 
 
 		 141 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 141 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.69 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.52 
 
 		 140 aa  48.5  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.63 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.48 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1296  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0153  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2646  putative ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.53 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1049  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0129  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  28.04 
 
 		 141 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.66 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  26.37 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.82 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.69 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.1 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.91 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.52 
 
 		 138 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.33 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3136  F0F1-type ATP synthase, subunit B  37.78 
 
 		 141 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  37.78 
 
 		 141 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>