190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2587 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  277  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  30.5 
 
 
141 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.21 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.03 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.5 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.17 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.87 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  32.39 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.56 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.87 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.47 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.57 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.92 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  31.47 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  31.47 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.1 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.89 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.52 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  30.83 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.37 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.37 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  26.39 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  26.35 
 
 
156 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.72 
 
 
167 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  23.61 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  22.79 
 
 
153 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 
156 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 
156 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22.96 
 
 
173 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22.96 
 
 
173 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.97 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  26.49 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  26.39 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  26.39 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  26.39 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  26.21 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  25.71 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.01 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  26.39 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.06 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  24.81 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.62 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  22.14 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  26.43 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  22.9 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  22.7 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>