62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2183 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 139 aa  274  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.26 
 
 		 138 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.88 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  36.5 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.71 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.04 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  27.01 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.68 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.93 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.5 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.59 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  28.8 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.68 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  29.57 
 
 		 264 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  24.64 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.21 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.01 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  24.29 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  24.82 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.56 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  23.88 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  26.09 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.19 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  21.21 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  21.21 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  41.94 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.56 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.93 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.56 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  31.17 
 
 		 247 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.95 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  36.92 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  35.38 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  25.87 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  25.87 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  23.36 
 
 		 169 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  23.36 
 
 		 169 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  23.36 
 
 		 169 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 		 156 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  35.21 
 
 		 249 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 164 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  22.3 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  27.82 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  21.21 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  24.82 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  22.63 
 
 		 189 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  23.91 
 
 		 175 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.1 
 
 		 259 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>