98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2826 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  71.74 
 
 		 138 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  58.7 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.65 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.88 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.1 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  34.06 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.16 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.88 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  32.86 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.71 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  26.98 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.26 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.09 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  29.23 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  32.41 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25.95 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  33.09 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.13 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  27.66 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.79 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  25 
 
 		 264 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.32 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.24 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.34 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.06 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  29.71 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.14 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.51 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  30 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  24.6 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.78 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.95 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.34 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.67 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.36 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.67 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  24.29 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  24.31 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.99 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.03 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  28.79 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 161 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  24.19 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  26.81 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  26.81 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  27.13 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  32.31 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  23.66 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  23.66 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  24.11 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.21 
 
 		 153 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.21 
 
 		 153 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>