57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3411 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 141 aa  267  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  74.47 
 
 		 141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  66.91 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  57.45 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.19 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.61 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  63.12 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  61.7 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.46 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.57 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.06 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.93 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  34.78 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.06 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.35 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  34.21 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  34.21 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.84 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  26.52 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3136  F0F1-type ATP synthase, subunit B  25.53 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  25.53 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.74 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.29 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  26.05 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  32.79 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  31.67 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  35 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  32.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  34.65 
 
 		 253 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  28.76 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.95 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  28.47 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.34 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.91 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  29.63 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  36.62 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  25.37 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  23.36 
 
 		 195 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  27.62 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  22.76 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.19 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.08 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.48 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.24 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4337  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 159 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00401798  normal  0.759858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>