56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4258 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  66.18 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  66.91 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  66.91 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  66.91 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.41 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.74 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.68 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.59 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.34 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  33.33 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.06 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.52 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3136  F0F1-type ATP synthase, subunit B  25.74 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.57 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  25.74 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.2 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  25.93 
 
 		 264 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  37.76 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  30.38 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.22 
 
 		 259 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  25.74 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  32.87 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  32.56 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  24.09 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  31.58 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.95 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  35.85 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  26.43 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  26.15 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  26.15 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.16 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.82 
 
 		 158 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.94 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.79 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  27.94 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  34.69 
 
 		 253 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.19 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  27.01 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>