117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0333 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
158 aa  301  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  55.77 
 
 
161 aa  167  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  57.05 
 
 
163 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  54.01 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  54.01 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.06 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.06 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.81 
 
 
154 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.43 
 
 
153 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.43 
 
 
153 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.43 
 
 
153 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.72 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.16 
 
 
154 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15731  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.31 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.723597  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  55.8 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  54.35 
 
 
143 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.14 
 
 
151 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3335  H+transporting two-sector ATPase subunit B/B'  59.29 
 
 
143 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.843429  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  32.37 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.55 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.09 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  32.79 
 
 
238 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.66 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.53 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.09 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.95 
 
 
181 aa  54.3  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.97 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.5 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.78 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 
193 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.03 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  32.61 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.34 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.61 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.77 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  29.71 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.62 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.47 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.86 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.41 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  28.47 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
173 aa  47.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
173 aa  47.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  28.67 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 
168 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.99 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  29.6 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.2 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  35.9 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.05 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.11 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  31.37 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  26.56 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  28.28 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  24.64 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  24.64 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  31.53 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  26.95 
 
 
164 aa  43.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  23.19 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.77 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  22.3 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.37 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>