More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0067 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
175 aa  338  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  33.76 
 
 
166 aa  101  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.43 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  35.5 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
162 aa  94.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 
175 aa  94.4  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  35.5 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  39.24 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0534  ATP synthase F0, B subunit  33.95 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0141265  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  37.58 
 
 
175 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  33.76 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0560  ATP synthase F0, B subunit  34.57 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0558474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_499  ATP synthase F0, B subunit  34.57 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000743335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  35.67 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
156 aa  89  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  35.67 
 
 
179 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
171 aa  88.2  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
181 aa  87.8  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  87.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
175 aa  87.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.97 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  32.32 
 
 
206 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  35.67 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  33.76 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.2 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.32 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  31.71 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.06 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  32.14 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.77 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  35.33 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.56 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  32.52 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  32.87 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  32.93 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  33.57 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.28 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0299  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  32.21 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  32.21 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  31.91 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  29.38 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.87 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>