89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6067 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 154 aa  298  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  35.97 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.17 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.88 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.75 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.21 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.46 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.62 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  30.22 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  30.22 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.82 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.86 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.79 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.26 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.39 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.39 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  32.39 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  28.37 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.06 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.58 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  29.58 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.19 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.01 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.2 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  25.5 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.66 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.06 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  30.99 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  26.81 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.71 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  31.54 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  28.17 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  33.68 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.56 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  26.06 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  30 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  30.87 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  31.36 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  26.76 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  28.78 
 
 		 193 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  26.76 
 
 		 156 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  24.65 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  30.51 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  25.19 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  26.11 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.94 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>