172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1623 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
146 aa  280  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  34.33 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  31.3 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.62 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  35.29 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.58 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.17 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  32.41 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.54 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.55 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.47 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  34.15 
 
 
175 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.71 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  24.06 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  24.06 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.26 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  24.06 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  27.18 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  30.99 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.06 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  29.71 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 
167 aa  53.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  31.96 
 
 
163 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  25 
 
 
264 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  24.26 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.66 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  26.26 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.32 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.55 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.55 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  30.59 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  27.43 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.91 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  29.51 
 
 
188 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  28.68 
 
 
193 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.01 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  27.01 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  26.72 
 
 
203 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  21.54 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  20.9 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
193 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  24.63 
 
 
206 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  26.15 
 
 
165 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  31.25 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  25.37 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  24.82 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>