91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3955 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 141 aa  276  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  96.45 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  60.99 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  55.32 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  66.91 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.61 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.48 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  63.12 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.17 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.86 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.78 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.06 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  32.09 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  35.29 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3136  F0F1-type ATP synthase, subunit B  28.87 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  28.87 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.39 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  28.37 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.03 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  30.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  31.11 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.37 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.37 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  33.8 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  29.46 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  35.11 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.21 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  30.61 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  38.57 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.74 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.65 
 
 		 259 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.05 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  29.73 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.28 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  45.59 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.19 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  27.66 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  23.45 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  27.82 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  27.66 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.87 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  31 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  36.54 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  24.31 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  30.69 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  33.91 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0211  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  24.31 
 
 		 156 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 		 156 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.95 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.04 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  34.09 
 
 		 278 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.34 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  34.65 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  39.62 
 
 		 413 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  26.87 
 
 		 175 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>