260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3634 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  85.96 
 
 		 179 aa  280  9e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  67.05 
 
 		 181 aa  231  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  59.88 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  57.47 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  55.09 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  50.89 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  49.38 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  51.15 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  51.88 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  52.35 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  46.58 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  46.3 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  49.12 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  49.44 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  46.82 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  46.06 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  41.24 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  47.37 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  43.48 
 
 		 193 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  46.29 
 
 		 196 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  45.45 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  41.1 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  45.34 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  41.25 
 
 		 194 aa  103  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  38.41 
 
 		 448 aa  94.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  34.48 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  32.52 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  33.33 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 		 443 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 		 443 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 		 443 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  40.26 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  32.32 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.23 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  41.45 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  38.06 
 
 		 449 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  44.14 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  34.52 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.88 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.63 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.24 
 
 		 445 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  35.85 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  35.46 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  33.09 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.72 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  32.41 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  32.88 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.77 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.2 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.01 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  33.93 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  32.08 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  24.2 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  32.65 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.61 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  35.61 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  28.05 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  32.84 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  36.69 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>