245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0332 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
181 aa  351  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  71.67 
 
 
179 aa  197  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  54.71 
 
 
182 aa  157  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  54.04 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  50.6 
 
 
200 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  47.59 
 
 
194 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  59.12 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  52.41 
 
 
188 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  48.28 
 
 
194 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  45.61 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  47.85 
 
 
192 aa  124  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  47.37 
 
 
193 aa  121  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  42.11 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  38.41 
 
 
181 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  46.67 
 
 
182 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  41.25 
 
 
179 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  45.58 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  38.51 
 
 
195 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  37.5 
 
 
191 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  36.42 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  39.77 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  36.57 
 
 
175 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  38.75 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  36.3 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  31.45 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  34.91 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  38.16 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  44.87 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  37.35 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  43.87 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.97 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  27.63 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  30.61 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  30 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.12 
 
 
445 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  25.97 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.13 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.67 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.48 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.13 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  31.34 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  30.08 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.34 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  30.6 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 
164 aa  61.2  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  30.49 
 
 
448 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 
164 aa  61.2  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  35.51 
 
 
179 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  24.69 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  30.32 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  23.12 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>