278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1068 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
193 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  69.49 
 
 
194 aa  244  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  62.69 
 
 
193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  63.39 
 
 
194 aa  205  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  61.31 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  51.83 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  51.43 
 
 
189 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  53.49 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  57.49 
 
 
182 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  53.8 
 
 
184 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  50.3 
 
 
181 aa  151  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  42.86 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  52.07 
 
 
182 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  57.23 
 
 
182 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  52.1 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  47.73 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  49.19 
 
 
188 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  55 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  54.88 
 
 
182 aa  131  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  45.76 
 
 
181 aa  131  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  48.4 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  45.18 
 
 
181 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  46.74 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  47.37 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  42.05 
 
 
193 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  45.96 
 
 
179 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  45.34 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  41.98 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  45.51 
 
 
179 aa  89  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  33.95 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  44.38 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  30.86 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  32.08 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  33.1 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.25 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  32.45 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  30.25 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  31.06 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  30.38 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  30.38 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.25 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  34.56 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.39 
 
 
443 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.39 
 
 
443 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.39 
 
 
443 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  26.58 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  32.89 
 
 
448 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.9 
 
 
446 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  32.39 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.53 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  35.66 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  36.15 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.89 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  36.18 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>