299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  100 
 
 
194 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  63.69 
 
 
193 aa  224  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  69.49 
 
 
193 aa  222  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  58.06 
 
 
200 aa  204  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  55.91 
 
 
194 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  52.44 
 
 
172 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  48.57 
 
 
179 aa  161  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  46.06 
 
 
180 aa  161  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  50.87 
 
 
181 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  53.85 
 
 
189 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  45.29 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  49.72 
 
 
188 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  50.28 
 
 
182 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  52.69 
 
 
182 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  49.4 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  49.71 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  49.72 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  51.65 
 
 
182 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  48.21 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  43.09 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  44.77 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.78 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  48.31 
 
 
179 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  52.27 
 
 
184 aa  124  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  46.24 
 
 
175 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  42.11 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  41.94 
 
 
191 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  44.26 
 
 
196 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  44.23 
 
 
179 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.68 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  43.83 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.63 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  34.39 
 
 
448 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  32.93 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  32.7 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.61 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.78 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.21 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  32.65 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.48 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  39.42 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.19 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.43 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  37.16 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.52 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  37.84 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  35.29 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  37.16 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  38.62 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  37.16 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.74 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.21 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  35.81 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  36.65 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  37.59 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  37.93 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  35.81 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  35.81 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  35.81 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  36.36 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  36.76 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  36.76 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  37.68 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  37.16 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  37.59 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>