269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12090 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  100 
 
 
199 aa  391  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  71.01 
 
 
206 aa  239  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  73.03 
 
 
203 aa  238  5.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  36 
 
 
203 aa  112  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  36.84 
 
 
179 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  36.26 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  35.67 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  35.71 
 
 
175 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  30.99 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  32.12 
 
 
181 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  30.13 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
175 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.21 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
171 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
173 aa  89  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
173 aa  89  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.39 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 
172 aa  85.5  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  33.78 
 
 
173 aa  85.1  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  32.93 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  32.32 
 
 
175 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  33.77 
 
 
164 aa  82  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  30.41 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  32.88 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  31.45 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  31.76 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.48 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  35.11 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.55 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.52 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.43 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  30.13 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.03 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  36.09 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  30.64 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.83 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  30.56 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.27 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.57 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  31.87 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  34.67 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  33.12 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.35 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  29.59 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  34.59 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.8 
 
 
443 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.8 
 
 
443 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.8 
 
 
443 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.92 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.38 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.14 
 
 
168 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  25.93 
 
 
163 aa  62  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
156 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  29.77 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>