85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2191 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.54 
 
 		 189 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  60.94 
 
 		 192 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  47.4 
 
 		 192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.18 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.97 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.83 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.9 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.49 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.51 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  29.19 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.17 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.19 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  23.39 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  25.81 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  25.14 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  25.14 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.05 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  28.39 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  25.81 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  22.81 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  26.01 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  26.38 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  25.85 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  24.52 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.98 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  24.12 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.98 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.8 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.63 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  22.5 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  23.9 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  22.7 
 
 		 238 aa  47.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  23.68 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  21.43 
 
 		 278 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  23.7 
 
 		 180 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  22.22 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  25.95 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0804  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.44 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0145  ATP synthase F0, B subunit  25.85 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.00203214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.29 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  26.38 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 166 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  24.18 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  26.42 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  22.67 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  24.14 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  21.15 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  21.3 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  25.69 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  21.82 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.88 
 
 		 202 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.88 
 
 		 202 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  23.6 
 
 		 170 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  28.16 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  22.73 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  19.86 
 
 		 326 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  22.97 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>