43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0602 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.33 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.94 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.3 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  53.37 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.22 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.22 
 
 		 199 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  32.83 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  32.83 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.1 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.24 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.23 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.86 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.32 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.61 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.67 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  28.49 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.36 
 
 		 261 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.88 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.59 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25.6 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  31.73 
 
 		 264 aa  45.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.49 
 
 		 166 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  30.41 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  25.42 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.95 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.95 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.97 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 		 159 aa  42  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  26.61 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  27.66 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>