105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2216 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
192 aa  380  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.9 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.4 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.08 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  50 
 
 
192 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.2 
 
 
193 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.76 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.03 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.12 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.07 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  28.57 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  28.57 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.56 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.95 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.19 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.41 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.4 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  29.3 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.87 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
175 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  22.37 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  31.74 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.38 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.41 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.41 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  22.37 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.32 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  23.66 
 
 
194 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  24 
 
 
238 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  25.97 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  22.37 
 
 
179 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.08 
 
 
162 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
175 aa  54.7  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1407  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  25.62 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  22.37 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.27 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.66 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.78 
 
 
171 aa  52  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  22.09 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0683  F0F1 ATP synthase subunit B  25.88 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.883671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  22.37 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  23.81 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0138  F0F1 ATP synthase subunit B  22.09 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.815294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 
168 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 
168 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  24.48 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25.16 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0098  F0F1 ATP synthase subunit B  22.6 
 
 
170 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  24.34 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  25.31 
 
 
168 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  24.84 
 
 
278 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  23.78 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  27.06 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0191  F0F1 ATP synthase subunit B  23.18 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.658435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  23.31 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  25.95 
 
 
159 aa  45.1  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  22.88 
 
 
189 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0145  ATP synthase F0, B subunit  24.03 
 
 
156 aa  44.7  0.0009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.00203214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  21.85 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  20.57 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  23.95 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  23.95 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  24.68 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  24.53 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.03 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  24.53 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  23.43 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  19.21 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  24.53 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  23.68 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.08 
 
 
326 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0804  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.29 
 
 
209 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  25.6 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>