22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0683 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0683  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
171 aa  337  5.9999999999999996e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.883671  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  47.02 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1529  F0F1 ATP synthase subunit B  49.1 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1734  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
169 aa  140  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0138  F0F1 ATP synthase subunit B  42.35 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.815294  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0191  F0F1 ATP synthase subunit B  41.03 
 
 
170 aa  124  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.658435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0098  F0F1 ATP synthase subunit B  43.79 
 
 
170 aa  121  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.61 
 
 
171 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  42.35 
 
 
170 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1407  F0F1 ATP synthase subunit B  31.18 
 
 
169 aa  84.3  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  26.79 
 
 
191 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  26.79 
 
 
191 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.32 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.29 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  25.88 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.61 
 
 
200 aa  48.5  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.19 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.08 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.05 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  25 
 
 
176 aa  40.8  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 
159 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>