68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0599 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
200 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.27 
 
 
189 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.83 
 
 
188 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  32.02 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.46 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.8 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.56 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.76 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.76 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  29.83 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  29.83 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  37.16 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.65 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.8 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  31.37 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  33.07 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.87 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.54 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
175 aa  58.2  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.41 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0804  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.15 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  24.52 
 
 
172 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.47 
 
 
264 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 
162 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.95 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  27.68 
 
 
181 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  32.41 
 
 
175 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  28.66 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
173 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  24.7 
 
 
238 aa  48.9  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
173 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  33.01 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
166 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  25.97 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 
168 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 
171 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
171 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.08 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  24.5 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  25.38 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.32 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.32 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.97 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 
156 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
179 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  22.08 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 
156 aa  41.2  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>