52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3954 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 199 aa  387  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  98.49 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  67.38 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  59.69 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  60.74 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.79 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.22 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.22 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  37.1 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  37.1 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  34.95 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.76 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.18 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.68 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.21 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.98 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.03 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.9 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.19 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.07 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.77 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  32.39 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.95 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  29.07 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  32.54 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.59 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  27.65 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.42 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  27.65 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.09 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.2 
 
 		 173 aa  48.9  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  31.13 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  27.22 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.95 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  28.99 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  27.98 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  28.82 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.57 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  34.83 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  32.2 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.03 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>