101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2586 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 
203 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.55 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.25 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.25 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  34.76 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  34.76 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
192 aa  94.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  34.1 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.38 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.23 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  34.87 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.64 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0804  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.1 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.89 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  27.92 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.22 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.18 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.78 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 
173 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 
173 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 
168 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.19 
 
 
162 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  27.67 
 
 
165 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.43 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  31.95 
 
 
164 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  26.83 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.98 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.98 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
181 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  32 
 
 
156 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  24.53 
 
 
164 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.67 
 
 
264 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  25.61 
 
 
179 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  26.22 
 
 
179 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  29.48 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  24.69 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 
156 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  24.07 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  27.71 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  25.14 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  26.11 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  25.43 
 
 
175 aa  48.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.67 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  26.22 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  22.29 
 
 
178 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.74 
 
 
261 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  22.93 
 
 
278 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.49 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 
156 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.52 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  24.22 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  26.25 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  25.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.94 
 
 
171 aa  45.1  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.22 
 
 
171 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  25.64 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.71 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  28.67 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
156 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.81 
 
 
175 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
164 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  28.65 
 
 
170 aa  42  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  23.73 
 
 
164 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 
156 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 
156 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>