127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3362 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
189 aa  363  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  45.08 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.5 
 
 
189 aa  151  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.97 
 
 
188 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  46.02 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.87 
 
 
193 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.5 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.8 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  28.11 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  28.11 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.27 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  25.99 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  23.49 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  27.65 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.11 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.45 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  25.85 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.19 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  25.29 
 
 
175 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  23.49 
 
 
166 aa  52.4  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.1 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  27.06 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  24 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.49 
 
 
167 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
171 aa  51.6  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  28.28 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  28.05 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  25.16 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.16 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  26.76 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 
156 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  25.15 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  25.15 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  24 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  23.03 
 
 
164 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.39 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  28.28 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  34.44 
 
 
302 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.76 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.76 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.92 
 
 
164 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.63 
 
 
180 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  30.84 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  27.63 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  23.13 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  22.86 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  28.22 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.2 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
172 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  28.22 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 
171 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  25.61 
 
 
164 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  25.52 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.4 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>