240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0172 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
175 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
175 aa  93.2  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  29.48 
 
 
175 aa  89  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.48 
 
 
175 aa  89  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.66 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.32 
 
 
175 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  35.15 
 
 
194 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
174 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  33.76 
 
 
175 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.48 
 
 
175 aa  85.5  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.88 
 
 
173 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  25.32 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
171 aa  79  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  34.16 
 
 
179 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 
165 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
179 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  34.16 
 
 
179 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  29.19 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  32.7 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  26.17 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  22.78 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  24.52 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  25.83 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 
179 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.22 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  24.71 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.82 
 
 
161 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  27.74 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
166 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
163 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.69 
 
 
164 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  28.48 
 
 
167 aa  62.4  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
164 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
159 aa  62  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.33 
 
 
179 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 
165 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  24.84 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.73 
 
 
165 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.93 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  26.67 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
163 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_499  ATP synthase F0, B subunit  27.06 
 
 
169 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000743335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 
189 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0560  ATP synthase F0, B subunit  27.06 
 
 
169 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0558474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 
164 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
175 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  38.46 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 
163 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
159 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  29.8 
 
 
163 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  24.53 
 
 
164 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0534  ATP synthase F0, B subunit  25.88 
 
 
169 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30 
 
 
161 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  23.13 
 
 
181 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  26.21 
 
 
156 aa  55.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  24 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.33 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.33 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.17 
 
 
164 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 
156 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  28.3 
 
 
159 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  27.69 
 
 
151 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.3 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.86 
 
 
189 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  30.21 
 
 
163 aa  52.8  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
443 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
443 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
443 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
156 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  26.11 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  28.17 
 
 
449 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>