94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0694 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  49.68 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  50.32 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  50.96 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  49.68 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.9 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  45.22 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  46.58 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  41.14 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.56 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  44.72 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.3 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.2 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.2 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.07 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.62 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  39.24 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.31 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.43 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  43.12 
 
 		 186 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.86 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.1 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.34 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  38.75 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.71 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.79 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  43.31 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  46.72 
 
 		 190 aa  84  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  44.97 
 
 		 163 aa  84  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  38.75 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.16 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.4 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.22 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.68 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.12 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.34 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.88 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.78 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.11 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.43 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  25.5 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  29.2 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.74 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.14 
 
 		 194 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  26.11 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.8 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  28.93 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  27.41 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  26.58 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.98 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.98 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  24.67 
 
 		 203 aa  43.9  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  24.56 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.22 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  28.28 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22.88 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.81 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22.88 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.35 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.16 
 
 		 207 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.84 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.08 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>