89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3027 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 186 aa  353  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  58.06 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  58.06 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  53.76 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  55.91 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  58.79 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  56.15 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.12 
 
 		 161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  44.52 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  43.23 
 
 		 159 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.26 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  38.61 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  36.77 
 
 		 161 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  42.58 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.03 
 
 		 163 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.75 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  40 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  41.06 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.52 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.53 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  38.12 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.71 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.62 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.25 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.19 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.32 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.62 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.82 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  34.94 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.94 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.68 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.12 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  35.19 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.52 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.27 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.05 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.83 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.59 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.88 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.21 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.71 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.97 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.01 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  26.79 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.78 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  27.75 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.67 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.4 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.61 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  32.93 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  30.5 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.32 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.06 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  25 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.51 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  29.32 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  29.32 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  28.27 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.19 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 		 175 aa  45.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.09 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.38 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.38 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.44 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  26.42 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.72 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.87 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.87 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.48 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 		 177 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.61 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.93 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>