73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7660 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 162 aa  304  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  90.68 
 
 		 161 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  72.22 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.46 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  72.22 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  54.37 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.75 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  71.6 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.12 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.5 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.97 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.87 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  44.3 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.96 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.62 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  51.25 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  43.04 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  42.14 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  34.59 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.88 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  37.97 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  38.12 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  39.38 
 
 		 185 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.27 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  40.26 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  41.33 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.41 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  42.5 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  45 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  44.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  45 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  36.94 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  42.28 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.4 
 
 		 183 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  46.94 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.13 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.19 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.17 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.49 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.88 
 
 		 204 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.12 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  25.16 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.76 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  26.97 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.34 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  22.84 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  20.99 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  24.24 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  26.54 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  20.78 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.79 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  36.9 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.7 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.79 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.86 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  21.6 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.82 
 
 		 207 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.72 
 
 		 193 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.85 
 
 		 207 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 		 192 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  27.66 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>