116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0502 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  91.22 
 
 
208 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  91.22 
 
 
208 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  59.61 
 
 
204 aa  232  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.38 
 
 
193 aa  217  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  55.87 
 
 
207 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  55.87 
 
 
207 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  48.12 
 
 
161 aa  170  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  52.45 
 
 
194 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.68 
 
 
187 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.74 
 
 
207 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.09 
 
 
187 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.88 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.36 
 
 
185 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.89 
 
 
185 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45 
 
 
185 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.62 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.62 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.47 
 
 
185 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.31 
 
 
187 aa  128  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.23 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.63 
 
 
200 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.32 
 
 
192 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.99 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  42.08 
 
 
186 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.65 
 
 
185 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.11 
 
 
189 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  40 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.76 
 
 
180 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.76 
 
 
180 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.06 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.36 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.73 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.99 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.29 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.61 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.35 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.53 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.33 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  33.96 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.17 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.77 
 
 
164 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.82 
 
 
163 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.76 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  28.35 
 
 
165 aa  52.8  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  26.25 
 
 
176 aa  52  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  27.97 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  33.64 
 
 
156 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
180 aa  51.6  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.78 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
166 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  38.21 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
156 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.43 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.37 
 
 
166 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.19 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  28.33 
 
 
172 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.83 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3970  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00376909  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.94 
 
 
163 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  35.77 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  33.78 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
159 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  34.15 
 
 
168 aa  47  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  25.85 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.05 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
159 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.47 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  30.85 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  30.1 
 
 
156 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 
171 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
163 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.1 
 
 
156 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.36 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.85 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.99 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.91 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  28.99 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.77 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.91 
 
 
162 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.36 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>