92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2592 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 181 aa  348  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  75.62 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  75.62 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  72.5 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  71.51 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.64 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  63.58 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.88 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.05 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.92 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.72 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.41 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.16 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.36 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.04 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.36 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.8 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.79 
 
 		 205 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.59 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.77 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.01 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.53 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.36 
 
 		 207 aa  90.9  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.34 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.58 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.58 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.73 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.65 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  41.14 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.58 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.93 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  35 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.03 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.65 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.07 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.93 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.33 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  31.78 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.75 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.49 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  30.95 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  29.55 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  36.56 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  31.28 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  32.35 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  39.56 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  20.55 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.62 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.68 
 
 		 203 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.25 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  28.79 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.73 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0429  ATP synthase F0, B subunit, putative  28.89 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  33.85 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 		 446 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  30.39 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  30.87 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.51 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  33.33 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  33.78 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  26 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.36 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 443 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 443 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 443 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1318  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.09 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.75 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.36 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  25.58 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.9 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  32.81 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  35.87 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  36.56 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.3 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  35.58 
 
 		 164 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 		 165 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.91 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  31.4 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  32.06 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.96 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.96 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>