74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3368 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  94.53 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  94.53 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  69.9 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  56.19 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  58.48 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.41 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.56 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.47 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  49.14 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48.17 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.95 
 
 		 185 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.61 
 
 		 183 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  46.86 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.61 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.86 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.63 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.5 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.5 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.06 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  46.58 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  46.58 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  45.71 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  47.88 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.31 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.33 
 
 		 189 aa  98.6  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.73 
 
 		 161 aa  91.7  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.81 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.81 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.06 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.59 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.43 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.69 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.2 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.69 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.45 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.62 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  35.4 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.8 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.76 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.99 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  25.81 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.76 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.07 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.2 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  24.24 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  25.81 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  24.1 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  26.87 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  39.02 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.54 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.92 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  27.05 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  27.2 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.44 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  22.56 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.36 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  35.56 
 
 		 168 aa  42  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.61 
 
 		 166 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.36 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>