65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0844 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  100 
 
 		 186 aa  362  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  71.51 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  69.89 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  69.89 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  67.2 
 
 		 185 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  71.51 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  68.98 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.83 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.91 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.53 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.86 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.86 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.86 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.2 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.71 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.71 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.81 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.76 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.08 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.76 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.01 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.94 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.8 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.67 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  44.31 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.58 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.67 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.69 
 
 		 180 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.69 
 
 		 180 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.28 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.56 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.65 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.43 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.86 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.68 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.26 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.27 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.19 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  30.63 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.78 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.38 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  23.13 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.11 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.17 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  24.72 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.67 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.81 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.03 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.8 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  31.93 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.56 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.13 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.69 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  25.32 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  32.73 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  25.58 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.86 
 
 		 166 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  27.01 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  31.96 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>