79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4485 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 163 aa  296  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  60.14 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1318  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48.77 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.93 
 
 		 181 aa  87.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.55 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.24 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.21 
 
 		 183 aa  84.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.53 
 
 		 205 aa  84.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.78 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.78 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.1 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.14 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.06 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.91 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.28 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.72 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.72 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.41 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.24 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.67 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.42 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.43 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.86 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.86 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.86 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.29 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.55 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.61 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.2 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.41 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.43 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.16 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.54 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.89 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.64 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  31.54 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.03 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.43 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  36.88 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.59 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.84 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  42.22 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  37.18 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  36.89 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.84 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28.89 
 
 		 206 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.56 
 
 		 199 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  27.74 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  37.88 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  38.26 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.61 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  35.9 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  39.84 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  37.21 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  35.96 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  32.22 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  39.34 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  34.71 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.29 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  27.45 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 		 156 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 		 156 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  40.35 
 
 		 156 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 		 156 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  25.71 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  31.3 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  37.7 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.23 
 
 		 203 aa  40.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  38.33 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>