56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0192 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 180 aa  347  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  95.56 
 
 		 180 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  95.56 
 
 		 180 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  74.31 
 
 		 181 aa  201  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  72.35 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.54 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  60.25 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.66 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.46 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.43 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.66 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.87 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.51 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.51 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.34 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.52 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.47 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.24 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.91 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.4 
 
 		 204 aa  87.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.47 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.11 
 
 		 188 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  41.36 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.76 
 
 		 161 aa  84.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.25 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.48 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.48 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.01 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.35 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.48 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.95 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.94 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.75 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  32.4 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.5 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.49 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  34.19 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  38.28 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  30.23 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.11 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.49 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.67 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  28.79 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  24.55 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.25 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  37.17 
 
 		 200 aa  44.3  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.65 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  38.98 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 		 194 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  32.52 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  32.98 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  34.42 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>