155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2621 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
179 aa  342  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  56.18 
 
 
178 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  56.18 
 
 
178 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  55.11 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  49.71 
 
 
171 aa  160  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  53.67 
 
 
177 aa  154  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.56 
 
 
181 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  49.19 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  38.89 
 
 
170 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  38.89 
 
 
170 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  36.72 
 
 
171 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 
170 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  35.4 
 
 
170 aa  98.2  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  35.47 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  36.16 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  36.09 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  37.27 
 
 
160 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  40 
 
 
160 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.11 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.58 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  26.58 
 
 
245 aa  57  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.44 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
156 aa  54.3  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.01 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  27.98 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  22.09 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
156 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
156 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
156 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  25.68 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
165 aa  51.2  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 
156 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.83 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.35 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  26.11 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  25.68 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  26.11 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  24.38 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3960  F0F1 ATP synthase subunit B  25.52 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  26.49 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  25.19 
 
 
166 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  21.88 
 
 
238 aa  47.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  26.44 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  30.38 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  25.97 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.41 
 
 
443 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.41 
 
 
443 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.41 
 
 
443 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  30.34 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>