38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0486 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 160 aa  309  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  80.62 
 
 		 160 aa  239  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  58.6 
 
 		 171 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  56.25 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  50.96 
 
 		 170 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  50.96 
 
 		 170 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  48.72 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  48.72 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  48.08 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  47.44 
 
 		 170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  39.49 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  39.49 
 
 		 178 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  39.49 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  41.25 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  39.47 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  39.38 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.71 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  35.86 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.85 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  25.15 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  25.15 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 156 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.27 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.27 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  24.34 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>