90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0989 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
192 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  64.58 
 
 
189 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  60.94 
 
 
188 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  46.15 
 
 
192 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.79 
 
 
189 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.33 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.18 
 
 
200 aa  92  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.82 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.89 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.73 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.91 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  29.65 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.16 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.38 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.65 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.3 
 
 
261 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  24.19 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  24.19 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.27 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  24.52 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  24.72 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.13 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  23.39 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  22.88 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0145  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
156 aa  52  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.00203214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.05 
 
 
199 aa  51.2  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.05 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  26.11 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  26.75 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  24.48 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  24.66 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  25.3 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  25.83 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  25.3 
 
 
178 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  26.63 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  23.78 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  27.04 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
166 aa  48.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.97 
 
 
162 aa  48.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
171 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.65 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.65 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  23.87 
 
 
174 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  21.47 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  23.81 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  24.81 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  21.34 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  21.34 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  27.16 
 
 
170 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  20.83 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  25.69 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  28.87 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  22.22 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  24.35 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  22.92 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  25.41 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.56 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  22.75 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  24.71 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  26.45 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  22.97 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  25.37 
 
 
166 aa  42  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  24.59 
 
 
187 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  27.07 
 
 
182 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  22 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  23.08 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  25.95 
 
 
164 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  25.95 
 
 
164 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  24.31 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  24.31 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>