79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2827 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  73.54 
 
 		 188 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  64.58 
 
 		 192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  48.9 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.5 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.6 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.27 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.48 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.65 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.87 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  27.17 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  27.17 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.26 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.18 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.87 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.63 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.57 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25.47 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  26.04 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.06 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  27.44 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.21 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  26.06 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.21 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22.16 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22.16 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  24.34 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  24.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  25.85 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.75 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  25.49 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  22.67 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  21.79 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  21.79 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.23 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.23 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  22.38 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0804  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.73 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  25.6 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  23.08 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  23.86 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  21.34 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  27.67 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  21.71 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  25.87 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  25.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  27.91 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  22.67 
 
 		 264 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.93 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  23.72 
 
 		 164 aa  44.7  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.31 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25.32 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  23.26 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  21.05 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  23.73 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.66 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.65 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.89 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  25.97 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>