38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0804 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0804  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.81 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  29.44 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  29.44 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.61 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.44 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.6 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.06 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  26.29 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  21.85 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  25.6 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25.3 
 
 		 173 aa  48.5  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.05 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  22.35 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.46 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  25.16 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25 
 
 		 264 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  24.38 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  24.38 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  22.15 
 
 		 171 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  23.42 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.64 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.08 
 
 		 164 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>