61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6946 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  88.77 
 
 		 187 aa  337  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  55.15 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  55.26 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  55.15 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  61.4 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.88 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.92 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  47.37 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.59 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.68 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.29 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.29 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  48.47 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.39 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.05 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.75 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.38 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.62 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  47.53 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.56 
 
 		 187 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.3 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.66 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.64 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.97 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  47.3 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.5 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.38 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.69 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.24 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.24 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.52 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.08 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.81 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.05 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.06 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.06 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.53 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.17 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  31.91 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  32.85 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  32.85 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  33.59 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.73 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  27.37 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  25.56 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.59 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.78 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  23.85 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.8 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.97 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  30.28 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.82 
 
 		 163 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.76 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  27.08 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  24.2 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  25.77 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>