81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1976 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 163 aa  308  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  53.99 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  55.41 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.69 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  56.05 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.05 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  49.68 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.05 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.14 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  45.22 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  45.22 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  43.31 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.29 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.23 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  42.04 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.96 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  48.41 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.32 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.57 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  46.5 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.79 
 
 		 182 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  37.42 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  47.02 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.92 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 		 184 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.56 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.64 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  44.94 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  42.48 
 
 		 185 aa  87.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.13 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.6 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  39.38 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  49.46 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  45.69 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  44.83 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.95 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  43.97 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.23 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.82 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.35 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.88 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.88 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.11 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.61 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.64 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  32.58 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.04 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.1 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.93 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.75 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.24 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.63 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.11 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  34.38 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  32.64 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.16 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.62 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  26.42 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.38 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.19 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.04 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.85 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.97 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.85 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.1 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  26.42 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  25.81 
 
 		 238 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 		 175 aa  43.9  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.08 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  27.69 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  30.25 
 
 		 164 aa  42  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.1 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.53 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.65 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>