79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3367 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 162 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  95.68 
 
 		 162 aa  253  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  95.68 
 
 		 162 aa  249  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  74.53 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  77.78 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.46 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.8 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  52.8 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.78 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.78 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.23 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.5 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  43.4 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.1 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  44.65 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  40.37 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  43.4 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.17 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  34.59 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  40.25 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  42.24 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.69 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  40.51 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  43.31 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  45.03 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  37.97 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.12 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.06 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.77 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  40.98 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  47.96 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  37.04 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  39.34 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.94 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.1 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.21 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.49 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.83 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.85 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  26.17 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  22.88 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.3 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.7 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.09 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  25.52 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  23.84 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.08 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.08 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  30 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  32.53 
 
 		 203 aa  44.3  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.14 
 
 		 189 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  25.97 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  36.36 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.61 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.58 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.93 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  24.18 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 		 171 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  22.48 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.23 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.23 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  23.03 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>