66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4486 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 205 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  59.63 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  60.12 
 
 		 184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  42.38 
 
 		 159 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  42.38 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  42.38 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.65 
 
 		 161 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  41.13 
 
 		 159 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.54 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.47 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.46 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  44.14 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  35.03 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  36.99 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  41.36 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  41.36 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.82 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.27 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  41.83 
 
 		 184 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  39.13 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.26 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  42.11 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.61 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.4 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.61 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  32.92 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  27.93 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  39.13 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  24.1 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  34.97 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.68 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.46 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.19 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.19 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.26 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.79 
 
 		 161 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.32 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25.32 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 		 180 aa  48.5  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.91 
 
 		 168 aa  48.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.29 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  27.61 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 		 164 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 		 164 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.09 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  34.48 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  32.61 
 
 		 796 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  20.89 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  25.16 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  26.71 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  26.42 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  30.5 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.22 
 
 		 189 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  26.22 
 
 		 164 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.04 
 
 		 181 aa  42  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  22.36 
 
 		 163 aa  41.6  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>