76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0740 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
161 aa  306  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.29 
 
 
163 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.71 
 
 
164 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  48.67 
 
 
163 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.34 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.02 
 
 
163 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 
162 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  57.23 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.37 
 
 
162 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.28 
 
 
161 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  39.49 
 
 
161 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.41 
 
 
163 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  46.55 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.98 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  38.82 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  42.38 
 
 
184 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  39.24 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.41 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  43.85 
 
 
159 aa  90.9  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  43.94 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.1 
 
 
161 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  32.08 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  40.51 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  41.03 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.11 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.63 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  42.57 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  41.53 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  38.61 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.23 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  37.97 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  40.68 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.01 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.44 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  38.82 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.27 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  38.17 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.75 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.06 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.26 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.89 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  32.9 
 
 
189 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
166 aa  50.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.76 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  28.39 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.88 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.69 
 
 
208 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.69 
 
 
208 aa  47.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.33 
 
 
193 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.08 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.88 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.1 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.77 
 
 
207 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  28.75 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  34.94 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.39 
 
 
207 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.54 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.63 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  23.36 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.11 
 
 
185 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.79 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.79 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.58 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
172 aa  41.2  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  36.71 
 
 
238 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.46 
 
 
207 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  24.66 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.26 
 
 
201 aa  40.8  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.26 
 
 
201 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>